Samir Bhatt

Samir Bhatt

Professor


Udgivelsesår:
  1. 2023
  2. Udgivet

    Seasonal dynamics of Anopheles stephensi and its implications for mosquito detection and emergent malaria control in the Horn of Africa

    Whittaker, Charles Frederick, Hamlet, A., Sherrard-Smith, E., Winskill, P., Cuomo-Dannenburg, G., Walker, P. G. T., Sinka, M., Pironon, S., Kumar, A., Ghani, A., Bhatt, Samir & Churcher, T. S., 2023, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 8, 9 s., e2216142120.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Semi-mechanistic Bayesian modelling of COVID-19 with renewal processes

    Bhatt, Samir, Ferguson, N., Flaxman, S., Gandy, A., Mishra, S. & Scott, J. A., 2023, I: Journal of the Royal Statistical Society. Series A: Statistics in Society. 186, 4, s. 633-636 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Seq2Seq Surrogates of Epidemic Models to Facilitate Bayesian Inference

    Charles, G., Wolock, T. M., Winskill, P., Ghani, A., Bhatt, Samir & Flaxman, S., 2023, AAAI-23 Special Tracks. Williams, B., Chen, Y. & Neville, J. (red.). AAAI Press, s. 14170-14177 8 s. (Proceedings of the 37th AAAI Conference on Artificial Intelligence, AAAI 2023, Bind 37).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  5. Spatiotemporal and Seasonal Trends of Class A and B Notifiable Infectious Diseases in China: Retrospective Analysis

    Zheng, J., Zhang, N., Shen, G., Liang, F., Zhao, Y., He, X., Wang, Y., He, R., Chen, W., Xue, H., Shen, Y., Fu, Y., Zhang, W. H., Zhang, L., Bhatt, Samir, Mao, Y. & Zhu, B., 2023, I: JMIR Public Health and Surveillance. 9, 19 s., e42820.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Unifying incidence and prevalence under a time-varying general branching process

    Pakkanen, M. S., Miscouridou, X., Penn, M. J., Whittaker, Charles Frederick, Berah, T., Mishra, S., Mellan, T. A. & Bhatt, Samir, 2023, I: Journal of Mathematical Biology. 87, 2, 34 s., 35.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. 2022
  8. Udgivet

    π VAE: a stochastic process prior for Bayesian deep learning with MCMC

    Mishra, S., Flaxman, S., Berah, T., Zhu, H., Pakkanen, M. & Bhatt, Samir, 2022, I: Statistics and Computing. 32, 6, 16 s., 96.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. A COVID-19 model for local authorities of the United Kingdom

    Mishra, S., Scott, J. A., Laydon, D. J., Zhu, H., Ferguson, N. M., Bhatt, Samir, Flaxman, S. & Gandy, A., 2022, I: Journal of the Royal Statistical Society. Series A: Statistics in Society. 185, s. S86-S95 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A dataset of non-pharmaceutical interventions on SARS-CoV-2 in Europe

    Altman, G., Ahuja, J., Monrad, J. T., Dhaliwal, G., Rogers-Smith, C., Leech, G., Snodin, B., Sandbrink, J. B., Finnveden, L., Norman, A. J., Oehm, S. B., Sandkuehler, J. F., Kulveit, J., Flaxman, S., Gal, Y., Mishra, S., Bhatt, Samir, Sharma, M., Mindermann, S. & Brauner, J. M., 2022, I: Scientific Data. 9, 1, 9 s., 145.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A novel statistical framework for exploring the population dynamics and seasonality of mosquito populations

    Whittaker, C., Winskill, P., Sinka, M., Pironon, S., Massey, C., Weiss, D. J., Nguyen, M., Gething, P. W., Kumar, A., Ghani, A. & Bhatt, Samir, 2022, I: Proceedings. Biological sciences. 289, 1972, 10 s., 20220089.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Comparative analysis of the risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron (B.1.1.529) and delta (B.1.617.2) variants in England: a cohort study

    Nyberg, T., Ferguson, N. M., Nash, S. G., Webster, H. H., Flaxman, S., Andrews, N., Hinsley, W., Bernal, J. L., Kall, M., Bhatt, S., Blomquist, P., Zaidi, A., Volz, E., Aziz, N. A., Harman, K., Funk, S., Abbott, S., Hope, R., Charlett, A., Chand, M. & 7 flere, Ghani, A. C., Seaman, S. R., Dabrera, G., De Angelis, D., Presanis, A. M., Thelwall, S. & COVID 19 Genom UK COG UK Consortiu, C. 1. G. U. C. U. C., 2022, I: Lancet. 399, 10332, s. 1303-1312 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Context-specific emergence and growth of the SARS-CoV-2 Delta variant

    McCrone, J. T., Hill, V., Bajaj, S., Pena, R. E., Lambert, B. C., Inward, R., Bhatt, S., Volz, E., Ruis, C., Dellicour, S., Baele, G., Zarebski, A. E., Sadilek, A., Wu, N., Schneider, A., Ji, X., Raghwani, J., Jackson, B., Colquhoun, R., O’Toole, Á. & 21 flere, Peacock, T. P., Twohig, K., Thelwall, S., Dabrera, G., Myers, R., Faria, N. R., Huber, C., Bogoch, I. I., Khan, K., du Plessis, L., Barrett, J. C., Aanensen, D. M., Barclay, W. S., Chand, M., Connor, T., Loman, N. J., Suchard, M. A., Pybus, O. G., Rambaut, A., Kraemer, M. U. G. & The COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, T. C. G. U. (. C., 2022, I: Nature. 610, 7930, s. 154-160 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Global disparities in SARS-CoV-2 genomic surveillance

    Brito, A. F., Semenova, E., Dudas, G., Hassler, G. W., Kalinich, C. C., Kraemer, M. U. G., Ho, J., Tegally, H., Githinji, G., Agoti, C. N., Matkin, L. E., Whittaker, C., Howden, B. P., Sintchenko, V., Zuckerman, N. S., Mor, O., Blankenship, H. M., de Oliveira, T., Lin, R. T. P., Siqueira, M. M. & 26 flere, Resende, P. C., Vasconcelos, A. T. R., Spilki, F. R., Aguiar, R. S., Alexiev, I., Ivanov, I. N., Philipova, I., Carrington, C. V. F., Sahadeo, N. S. D., Gurry, C., Maurer-Stroh, S., Naidoo, D., von Eije, K. J., Perkins, M. D., van Kerkhove, M., Hill, S. C., Sabino, E. C., Pybus, O. G., Dye, C., Bhatt, Samir, Flaxman, S., Suchard, M. A., Grubaugh, N. D., Baele, G., Faria, N. R. & Danish Covid-19 Genome Consortium, D. C. G. C., 2022, (medRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  15. Udgivet

    Global disparities in SARS-CoV-2 genomic surveillance

    Communicable Diseases Genomics Network (Australia and New Zealand), C. D. G. N. (. A. N. Z., COVID-19 Impact Project, C. I. P., Danish Covid-19 Genome Consortium, D. C. G. C., Fiocruz COVID-19 Genomic Surveillance Network, F. C. G. S. N., GISAID core curation team, G. C. C. T., Network for Genomic Surveillance in South Africa (NGS-SA), N. F. G. S. I. S. A. (., Swiss SARS-CoV-2 Sequencing Consortium, S. S. S. C. & Bulgarian SARS-CoV-2 sequencing group, B. S. S. G., 2022, I: Nature Communications. 13, s. 7003 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Global, regional, and national minimum estimates of children affected by COVID-19-associated orphanhood and caregiver death, by age and family circumstance up to Oct 31, 2021: an updated modelling study

    Unwin, H. J. T., Hillis, S., Cluver, L., Flaxman, S., Goldman, P. S., Butchart, A., Bachman, G., Rawlings, L., Donnelly, C. A., Ratmann, O., Green, P., Nelson, C. A., Blenkinsop, A., Bhatt, Samir, Desmond, C., Villaveces, A. & Sherr, L., 2022, I: The Lancet Child & Adolescent Health. 6, 4, s. 249-259 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Mask wearing in community settings reduces SARS-CoV-2 transmission

    Leech, G., Rogers-Smith, C., Monrad, J. T., Sandbrink, J. B., Snodin, B., Zinkov, R., Rader, B., Brownstein, J. S., Gal, Y., Bhatt, Samir, Sharma, M., Mindermann, S., Brauner, J. M. & Aitchison, L., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 23, 9 s., e2119266119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Misclassification bias in estimating clinical severity of SARS-CoV-2 variants – Authors' reply

    Nyberg, T., Ferguson, N. M., Blake, J., Hinsley, W., Bhatt, Samir, De Angelis, D., Thelwall, S. & Presanis, A. M., 2022, I: The Lancet. 400, 10355, s. 809-810 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Modeling DREAMS impact: trends in new HIV diagnoses among women attending antenatal care clinics in DREAMS countries

    Saul, J., Cooney, C., Hosseini, P. R., Beamon, T., Toiv, N., Bhatt, Samir, Zaidi, I. & Birx, D., 2022, I: AIDS. 36, s. S51-S59 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Novel Epidemic Metrics to Communicate Outbreak Risk at the Municipality Level: Dengue and Zika in the Dominican Republic

    Kingston, R., Routledge, I., Bhatt, Samir & Bowman, L. R., 2022, I: Viruses. 14, 1, 18 s., 162.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. PriorVAE: Encoding spatial priors with variational autoencoders for small-area estimation

    Semenova, E., Xu, Y., Howes, A., Rashid, T., Bhatt, Samir, Mishra, S. & Flaxman, S., 2022, I: Journal of the Royal Society Interface. 19, 191, 11 s., 20220094.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Purifying Selection Determines the Short-Term Time Dependency of Evolutionary Rates in SARS-CoV-2 and pH1N1 Influenza

    Ghafari, M., Du Plessis, L., Raghwani, J., Bhatt, Samir, Xu, B., Pybus, O. G. & Katzourakis, A., 2022, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 39, 2, 8 s., msac009.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Quantifying Changes in Vaccine Coverage in Mainstream Media as a Result of the COVID-19 Outbreak: Text Mining Study

    Christensen, B., Laydon, D., Chelkowski, T., Jemielniak, D., Vollmer, M., Bhatt, Samir & Krawczyk, K., 2022, I: JMIR Infodemiology. 2, 2, 15 s., e35121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Resurgence of malaria in Uganda despite sustained indoor residual spraying and repeated long lasting insecticidal net distributions

    Epstein, A., Maiteki-sebuguzi, C., Namuganga, J. F., Nankabirwa, J. I., Gonahasa, S., Opigo, J., Staedke, S. G., Rutazaana, D., Arinaitwe, E., Kamya, M. R., Bhatt, Samir, Rodríguez-barraquer, I., Greenhouse, B., Donnelly, M. J., Dorsey, G. & Ashton, R. (red.), 2022, I: PLOS Global Public Health. 2, 9, 18 s., e0000676.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Risk of hospitalisation associated with infection with SARS-CoV-2 omicron variant versus delta variant in Denmark: an observational cohort study

    Bager, P., Wohlfahrt, J., Bhatt, S., Stegger, M., Legarth, R., Møller, C. H., Skov, R. L., Valentiner-Branth, P., Voldstedlund, M., Fischer, T. K., Simonsen, L., Kirkby, N. S., Thomsen, M. K., Spiess, K., Marving, E., Larsen, N. B., Lillebaek, T., Ullum, H., Mølbak, K., Krause, T. G. & 28 flere, Edslev, S. M., Sieber, R. N., Ingham, A. C., Overvad, M., Agermose Gram, M., Kristensen Lomholt, F., Hallundbæk, L., Hjorth Espensen, C., Gubbels, S., Karakis, M., Lauenborg Møller, K., Schytte Olsen, S., Harboe, Zitta F B Barrella, Klint Johannesen, C., van Wijhe, M., Holler, J. G., Dessau, R. B. C., Barfred Friis, M., Fuglsang-Damgaard, D., Pinholt, M., Vognbjerg Sydenham, T., Coia, J. E., Marmolin, E. S., Fomsgaard, A., Fonager, J., Rasmussen, M., Cohen, A. & the Omicron-Delta study group, T. O. S. G., 2022, I: The Lancet Infectious Diseases. 22, 7, s. 967-976 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Seasonal variation in SARS-CoV-2 transmission in temperate climates: A Bayesian modelling study in 143 European regions

    Gavenciak, T., Monrad, J. T., Leech, G., Sharma, M., Mindermann, S., Bhatt, Samir, Brauner, J. & Kulveit, J., 2022, I: PLoS Computational Biology. 18, 8, 14 s., 1010435.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Spatial and temporal fluctuations in COVID-19 fatality rates in Brazilian hospitals

    Brizzi, A., Whittaker, C., Servo, L. M. S., Hawryluk, I., Prete, C. A., de Souza, W. M., Aguiar, R. S., Araujo, L. J. T., Bastos, L. S., Blenkinsop, A., Buss, L. F., Candido, D., Castro, M. C., Costa, S. F., Croda, J., de Souza Santos, A. A., Dye, C., Flaxman, S., Fonseca, P. L. C., Geddes, V. E. V. & 21 flere, Gutierrez, B., Lemey, P., Levin, A. S., Mellan, T., Bonfim, D. M., Miscouridou, X., Mishra, S., Monod, M., Moreira, F. R. R., Nelson, B., Pereira, R. H. M., Ranzani, O., Schnekenberg, R. P., Semenova, E., Sonabend, R., Souza, R. P., Xi, X., Sabino, E. C., Faria, N. R., Bhatt, Samir & Ratmann, O., 2022, I: Nature Medicine. 28, 7, s. 1476-1485 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 255978193